MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-9

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000954	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000954	ATT	2	6	3396	3401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000954	T	6	6	3511	3516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000954	ATC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_000954	TGG	3	9	3657	3665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000954	AAT	2	6	3736	3741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000954	TAG	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000954	TAA	2	6	3800	3805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000954	CAC	2	6	3835	3840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_000954	TTTA	2	8	3901	3908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000954	GTAA	2	8	3939	3946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000954	GGA	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000954	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000954	TGA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000954	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000954	TAA	2	6	4298	4303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000954	TC	3	6	4318	4323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_000954	ATT	2	6	4350	4355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000954	TTA	2	6	4360	4365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000954	TTCAA	2	10	4391	4400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_000954	A	6	6	4409	4414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000954	CTT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_000954	ATCA	2	8	4462	4469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_000954	AGA	2	6	4476	4481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000954	TAA	2	6	4494	4499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000954	A	6	6	4523	4528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000954	ATG	2	6	4579	4584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000954	TC	3	6	4606	4611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_000954	GCA	3	9	4630	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_000954	GCA	2	6	4645	4650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000954	GGA	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000954	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000954	AGA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000954	TTA	2	6	4781	4786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000954	TCAT	2	8	4857	4864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_000954	AGG	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000954	CTA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_000954	TAG	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000954	ATT	2	6	6778	6783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000954	TGC	2	6	6833	6838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_000954	TAA	2	6	6866	6871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000954	GAA	2	6	6915	6920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000954	GAAAA	2	10	6931	6940	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000954	A	6	6	6937	6942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000954	T	6	6	6968	6973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000954	GAA	2	6	6984	6989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000954	A	6	6	7040	7045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000954	AC	3	6	7064	7069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_000954	TGT	2	6	7073	7078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000954	TTA	2	6	7081	7086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000954	GAT	2	6	7107	7112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000954	TAA	2	6	7139	7144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000954	T	7	7	7163	7169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000954	AGAA	2	8	7232	7239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000954	GCTG	2	8	7346	7353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_000954	TTG	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000954	CTT	2	6	7419	7424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_000954	AAG	2	6	7459	7464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000954	TA	3	6	7512	7517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000954	A	6	6	7517	7522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000954	ATT	2	6	7530	7535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000954	TTA	2	6	7540	7545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000954	CTGCA	2	10	7585	7594	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_000954	ATT	2	6	7671	7676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000954	TAC	2	6	7784	7789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_000954	TTA	2	6	8284	8289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000954	ATTT	2	8	8511	8518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000954	TTA	2	6	8520	8525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000954	TTG	2	6	8537	8542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000954	AAT	2	6	8544	8549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000954	A	6	6	8592	8597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000954	TGAG	2	8	8615	8622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000954	AAT	2	6	8629	8634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000954	TTG	2	6	8645	8650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000954	TCA	2	6	8704	8709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_000954	A	7	7	10295	10301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000954	TAA	3	9	10333	10341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000954	GAAAA	2	10	10364	10373	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000954	A	7	7	10370	10376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000954	A	6	6	10383	10388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000954	GAAAA	2	10	10400	10409	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000954	A	7	7	10406	10412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000954	A	6	6	10419	10424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000954	GAAAA	2	10	10436	10445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000954	A	6	6	10442	10447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000954	A	6	6	10454	10459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000954	AGAA	2	8	10475	10482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000954	AAT	2	6	10500	10505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000954	TAA	2	6	10514	10519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000954	T	6	6	10551	10556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000954	T	6	6	10609	10614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000954	A	6	6	10623	10628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000954	TAT	2	6	10684	10689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000954	TA	3	6	10772	10777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000954	CTTT	2	8	10786	10793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_000954	AAC	2	6	10853	10858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_000954	TAGAAT	2	12	11999	12010	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000954	GAAT	2	8	12034	12041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000954	AAG	2	6	12070	12075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000954	AAG	2	6	12151	12156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000954	CA	3	6	12195	12200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_000954	A	6	6	12200	12205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000954	TCAA	2	8	12257	12264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_000954	TA	3	6	12318	12323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000954	AATCT	2	10	12351	12360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_000954	AAT	2	6	12387	12392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000954	AAC	2	6	12410	12415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_000954	CA	3	6	12476	12481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_000954	AGG	2	6	12482	12487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000954	ATTA	2	8	12531	12538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000954	TAAT	2	8	12582	12589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000954	ACAGAA	2	12	13858	13869	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_000954	AT	3	6	13953	13958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000954	TATC	2	8	13982	13989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_000954	TGA	2	6	14070	14075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000954	TAC	2	6	14124	14129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_000954	TAA	2	6	14168	14173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000954	AAAC	2	8	14174	14181	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_000954	TAC	2	6	14184	14189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_000954	ATTT	2	8	14190	14197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000954	A	7	7	14226	14232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000954	AAG	2	6	14249	14254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000954	A	6	6	14273	14278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000954	ATT	2	6	14342	14347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000954	TAA	2	6	14371	14376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000954	AAC	2	6	14405	14410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_000954	AGG	2	6	14413	14418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000954	TGA	2	6	14428	14433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000954	TGA	2	6	14452	14457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000954	AGA	2	6	14458	14463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000954	TGA	2	6	14527	14532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000954	GAA	2	6	14651	14656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000954	ATTA	2	8	14710	14717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000954	CTA	2	6	14727	14732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_000954	ATC	2	6	14782	14787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_000954	ATG	2	6	14805	14810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000954	TCT	2	6	14825	14830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_000954	A	6	6	14841	14846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000954	AAC	2	6	14859	14864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_000954	GAA	2	6	14895	14900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000954	TAA	2	6	14974	14979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000954	T	6	6	14991	14996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000954	TAG	2	6	15152	15157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000954	A	6	6	15187	15192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000954	CCTA	2	8	15196	15203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_000954	T	6	6	15242	15247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000954	TA	3	6	15275	15280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000954	A	6	6	15286	15291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000954	ATA	2	6	16616	16621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000954	CTA	2	6	17197	17202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_000954	ATA	2	6	17228	17233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000954	TAA	2	6	17257	17262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000954	TAA	3	9	17279	17287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000954	A	7	7	17286	17292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_000954	TGC	2	6	17776	17781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_000954	TAT	2	6	17901	17906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_000954	T	6	6	17921	17926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_000954	ATC	2	6	18010	18015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_000954	ATT	2	6	18019	18024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_000954	T	6	6	18051	18056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_000954	AAT	2	6	18058	18063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_000954	TAT	2	6	18072	18077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_000954	TGT	2	6	18082	18087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_000954	CTT	2	6	18123	18128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_000954	TAA	3	9	18140	18148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_000954	T	8	8	18157	18164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_000954	AAT	2	6	18196	18201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_000954	ATT	2	6	18202	18207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_000954	T	6	6	18243	18248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_000954	TTGT	2	8	18274	18281	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_000954	ATT	2	6	18307	18312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_000954	TGC	2	6	18322	18327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_000954	CAA	2	6	18402	18407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_000954	TAA	2	6	18528	18533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_000954	TCT	2	6	18623	18628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_000954	TTC	2	6	18695	18700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_000954	ATT	3	9	18757	18765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_000954	TCC	2	6	18789	18794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_000954	TAA	2	6	18807	18812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_000954	TA	3	6	18820	18825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_000954	CTT	2	6	18846	18851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_000954	A	6	6	18855	18860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_000954	A	6	6	18955	18960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_000954	TAC	2	6	18972	18977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_000954	GTA	2	6	18985	18990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_000954	TAA	2	6	19063	19068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_000954	T	7	7	19082	19088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_000954	AAATA	2	10	21574	21583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_000954	TAA	2	6	22746	22751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_000954	TA	3	6	22757	22762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_000954	T	6	6	22787	22792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_000954	AAAT	2	8	22889	22896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_000954	TAA	2	6	22941	22946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_000954	TATT	2	8	22953	22960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_000954	ATA	2	6	22961	22966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_000954	AAT	2	6	22990	22995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_000954	AGG	2	6	24558	24563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.